近日，一篇刊登在杂志Nature上题为“Whole-organism clone tracing using single-cell sequencing”的研究报告中，来自荷兰乌德勒支大学医学中心等机构的研究人员通过研究开发出了一种新方法，能够利用单细胞测序来进行整个生物有机体的克隆跟踪，文章中，研究人员描述了如何利用这种方法对条形码斑马鱼细胞（barcoded zebrafish cells）进行了研究。

研究者表示，胚胎发育是高度复杂的有机体发育的一个重要阶段，比如人类，仅有非常有限的胚胎祖细胞能够成功制造出成年机体内部所有类型的细胞，为了理解这一过程发生的机制，研究人员就需要新方法能够测定克隆历史的发生，同时还能在单细胞分辨率下进行细胞的识别；基于此，研究人员开发出了一种名为ScarTrace的新技术，该技术能够添加荧光蛋白转基因的串联拷贝，从而就能在CRISPR-Cas9基因编辑的转录过程中有效识别所的“疤痕”。

利用这一技术，研究人员就能够在编码的斑马鱼细胞中追踪克隆起源及细胞结果，更具体地说，研究者还能够从多个位点来追踪成体细胞，这些位点包括肾脏、眼睛等。研究者表示，当祖细胞开始分化增殖产生左眼或右眼组织时，这一技术就能足以研究整个过程，同时研究者还发现，斑马鱼皮肤和尾鳍中的细胞都来自于同一种祖细胞，此外研究人员还在鱼鳍中识别出了免疫细胞以及其它类型血细胞的不同克隆来源。

zui后研究者表示，ScarTrace技术或有望帮助研究人员实现zui终的研究目标，即追踪从单一细胞发育成为完整机体过程中所涉及的所有事件，目前研究人员正在同来自中国、英国和美国的科学家们进行合作，研究人员在文中详细描述了他们基于单细胞测序方法所开发出的MAP-seq是如何发挥作用的。（生物谷）

原始出处：

Anna Alemany, Maria Florescu, Chloé S. Baron, et al. Whole-organism clone tracing using single-cell sequencing. Nature 28 March 2018, doi:10.1038/nature25969